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去年2萬(wàn)頭豬因蝙蝠暴亡,中國(guó)SARS病毒源頭攻克團(tuán)隊(duì)又出手了
關(guān)鍵字: SARS非典型肺炎豬疫情SARS病毒2002年,首例SARS(非典型肺炎,嚴(yán)重急性呼吸道綜合征)爆發(fā)于廣東佛山。15年之后,在距離佛山100多公里的清遠(yuǎn)的某個(gè)養(yǎng)豬場(chǎng)內(nèi),開(kāi)始爆發(fā)一場(chǎng)嚴(yán)重的豬疫情,小仔豬在這場(chǎng)疫情里尤為脆弱,發(fā)病2天后即會(huì)死亡。
據(jù)澎湃新聞5日?qǐng)?bào)道,相關(guān)人員針對(duì)這些死豬檢測(cè)了所有已知的病毒后,均顯示為陰性,這讓人開(kāi)始意識(shí)到:或許是一種未知的新疫情已經(jīng)到來(lái)。與此同時(shí),養(yǎng)豬場(chǎng)附近發(fā)現(xiàn)有蝙蝠出沒(méi),它們飛翔在上空,對(duì)豬場(chǎng)“投下”糞便,然后飛回棲息地。而棲息地或許正位于豬場(chǎng)附近的山丘里。
這則新疫情最后的破解者是中國(guó)SARS病毒的源頭攻克團(tuán)隊(duì)。中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所研究院石正麗團(tuán)隊(duì)是團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人之一, “我們通過(guò)這項(xiàng)工作想提示一下,無(wú)論是養(yǎng)殖業(yè)還是公共衛(wèi)生,我們都要提前去預(yù)防由這些野生動(dòng)物傳到人類社會(huì)的這些病原,完全可以避免傳染病的大規(guī)模爆發(fā)?!?
石正麗等人在2005年曾在菊頭蝠身上找到了和SARS病毒相似的冠狀病毒,并于當(dāng)年將成果刊發(fā)于《科學(xué)》(Science)。2017年,石正麗等人終于在13年之后,在云南昆明地區(qū)一個(gè)小山洞里的蝙蝠身上發(fā)現(xiàn)了SARS病毒所有基因組成,基本完成了對(duì)SARS病毒的溯源工作。
而據(jù)工作人員介紹,研究團(tuán)隊(duì)在論文中將此番新發(fā)現(xiàn)的SADS疫情和當(dāng)年的SARS聯(lián)系在了一起,并提到3個(gè)相似和1個(gè)不同。
媒體2017年報(bào)道截圖
SARS樣冠狀病毒的自然宿主菊頭蝠。廣東省昆蟲(chóng)研究所張禮標(biāo)研究員供圖
破解最新這一疫情的成果于北京時(shí)間4月5日凌晨在線發(fā)表在頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《自然》(Nature)。論文的并列第一作者、中科院武漢病毒研究所研究員周鵬在接受澎湃新聞采訪時(shí)表示,“我們通過(guò)高通量測(cè)序后發(fā)現(xiàn),這是一種新的病毒,和來(lái)源于蝙蝠的HKU2官網(wǎng)病毒有95%的同源性,大家才意識(shí)到,這可能真的是來(lái)源于蝙蝠的一種病毒?!?
值得一提的是,得益于此前十余年的SARS研究,該成果前后只花了2個(gè)多月的時(shí)間。通訊作者之一、杜克-新加坡國(guó)立大學(xué)醫(yī)學(xué)院新發(fā)突發(fā)傳染病研究所所長(zhǎng)王林發(fā)提到,“這得益于大合作?!?
王林發(fā)表示,任何單獨(dú)一個(gè)組都無(wú)法快速完成這所有的工作。除石正麗、王林發(fā),該論文的通訊作者還包括美國(guó)生態(tài)健康聯(lián)盟(EcoHealth Alliance)主席Peter Daszak、軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所童貽剛、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院馬靜云。
4個(gè)養(yǎng)豬場(chǎng)爆發(fā)疫情
2016年10月28日起,廣東清遠(yuǎn)的一處養(yǎng)豬場(chǎng)開(kāi)始爆發(fā)致命的豬疫情。隨后,在距離該養(yǎng)豬場(chǎng)20-150千米范圍內(nèi)的另外3個(gè)農(nóng)場(chǎng)中也相繼爆發(fā)了該疫情。
截至2017年5月2日,差不多半年時(shí)間內(nèi),該疫情共計(jì)導(dǎo)致了4個(gè)養(yǎng)豬場(chǎng)中24693頭仔豬的死亡。在A農(nóng)場(chǎng)里,2月份出生的仔豬有64%(4659/7268)最終病死。
而最先爆發(fā)疫情的養(yǎng)豬場(chǎng)此前已經(jīng)因豬流行性腹瀉病毒(PEDV,一種冠狀病毒)爆發(fā)過(guò)疫情。論文中提到,最初在死豬的腸里發(fā)現(xiàn)PEDV病毒,然而2017年1月12日之后,小死豬的腸里再也檢測(cè)不到PEDV。
盡管死豬在急速增加,“但檢測(cè)了所有已知的病毒,顯示全部都是陰性的?!敝荠i提到。這些信息都在提示,這次疫情爆發(fā)是一種新的疾病。這一新的疫情最終被命名為豬急性腹瀉綜合征(SADS)。
該疫情的臨床癥狀和其他已知的腸道冠狀病毒引起的疫情相似,包括急性腹瀉、急性嘔吐。剛出生的仔豬在這場(chǎng)疫情面前尤其脆弱,出生5天以內(nèi)的仔豬會(huì)因體重快速下降而在發(fā)病2-4天后即死亡。
相比之下,隨著仔豬逐漸長(zhǎng)大,存活幾率會(huì)大增。5天或更小仔豬發(fā)病后的死亡率高達(dá)90%,在8天或更大的仔豬身上,這一死亡率就可下降到5%。同樣感染病毒的母豬生存幾率則更大一些,只會(huì)表現(xiàn)出輕微腹瀉,大多在2天后即恢復(fù)。
截至論文中接收前,疫情已經(jīng)減弱。研究人員用將生病母豬和仔豬從豬群中隔離出來(lái)等措施控制疫情。
石正麗研究組在野外作業(yè)。中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所供圖
SADS冠狀病毒導(dǎo)致疫情
基于SADS是一種未知病毒引起的新疫情這點(diǎn)假設(shè),研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)始正式解謎。
研究團(tuán)隊(duì)從患病仔豬小腸中收集樣本,用高通量測(cè)序技術(shù)來(lái)進(jìn)行宏基因組學(xué)分析。最終發(fā)現(xiàn),SADS冠狀病毒和蝙蝠冠狀病毒HKU2序列匹配。通過(guò)重新組裝,研究團(tuán)隊(duì)獲得了27173bp的SADS冠狀病毒基因,和HKU2冠狀病毒有95%的序列一致性。HKU2首先發(fā)現(xiàn)于在香港和廣東的中華菊頭蝠中。
研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),在4個(gè)養(yǎng)豬場(chǎng)的急性病仔豬和母豬身上均檢測(cè)到了SADS冠狀病毒,在恢復(fù)或健康的豬身上則沒(méi)有,在附近沒(méi)有SADS跡象的養(yǎng)豬場(chǎng)里也沒(méi)有檢測(cè)到。
回顧性PCR分析顯示,在PEDV爆發(fā)的時(shí)候,A農(nóng)場(chǎng)里還同時(shí)存在SADS冠狀病毒,該農(nóng)場(chǎng)里于2016年12月提取的第一個(gè)樣本表現(xiàn)出SADS冠狀病毒強(qiáng)陽(yáng)性。但從2017年1月中旬開(kāi)始,SADS冠狀病毒成為了病豬里檢測(cè)到的主要病毒。
研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,在PEDV感染完全檢測(cè)不到后出現(xiàn)了仔豬的大規(guī)模死亡這一事實(shí),暗示是SADS冠狀病毒引起了豬的致命感染,是那些大規(guī)模疫情爆發(fā)的真正原因,PEDV則不是直接因素。
在SADS爆發(fā)高峰期、以及爆發(fā)后期,4個(gè)養(yǎng)豬場(chǎng)里都沒(méi)有檢測(cè)到PEDV和其他一直的豬腹瀉病毒的存在,這些都支持了上述結(jié)論。
- 原標(biāo)題:中國(guó)病毒追蹤者:2萬(wàn)頭豬因蝙蝠暴亡,爆發(fā)地在首例非典附近
- 責(zé)任編輯:張晨靜
- 最后更新: 2018-04-05 15:32:27
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